曼哈顿学院任职时间最长的橄榄球教练。1973年开始在学校担任助理教练，并于次年接管了球队。贝克担任雅斯贝尔斯俱乐部足球队的主教练，直到1982年，他重建了这个项目，并在他的职业生涯中取得了30场胜利。

贝克把雅斯贝尔斯变成了一支让竞争对手害怕的劲旅。一些更传奇的时刻包括巴特·加拉格尔在对阵圣彼得队的最后一场比赛中的接球，以及迈克·康威在对阵法利·迪金森的比赛中奔跑350码。贾斯珀队没有真正的主场，却在全国版图上崭露头角。在1982赛季，曼哈顿队赢得了全国大学橄榄球协会（NCFA）大西洋联盟冠军，并在全国俱乐部锦标赛中唯一一次对阵不败的宾利队。贝克在1980年和1982年两次被评为NCFA年度最佳教练。鲍勃后来在佩斯大学当了九年的教练，担任助教、防守和主教练。他还曾在当地竞争对手福特汉姆大学（Fordham University）担任助教。